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for query gene Rpal_4034 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  84.94 
 
 
429 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  85.65 
 
 
444 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  100 
 
 
428 aa  843    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  67.84 
 
 
430 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  67.78 
 
 
422 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  35.71 
 
 
408 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.83 
 
 
401 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.71 
 
 
406 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.34 
 
 
405 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0859  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.29 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194721  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2187  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  35.71 
 
 
406 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.56 
 
 
405 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 
397 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.23 
 
 
420 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.06 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.51 
 
 
392 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.98 
 
 
398 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  32.53 
 
 
398 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.6 
 
 
393 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 
426 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  34.55 
 
 
392 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 
394 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  34.55 
 
 
392 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4471  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.49 
 
 
402 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.83 
 
 
411 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  34.29 
 
 
414 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
425 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
425 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.72 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.71 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.68 
 
 
402 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.54 
 
 
412 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.42 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 
465 aa  163  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  33.33 
 
 
402 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.17 
 
 
401 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.39 
 
 
389 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 
404 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.38 
 
 
405 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.04 
 
 
401 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.97 
 
 
401 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 
411 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.99 
 
 
393 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.48 
 
 
386 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.02 
 
 
411 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.97 
 
 
399 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.99 
 
 
393 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 
413 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.03 
 
 
399 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.37 
 
 
420 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.42 
 
 
389 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.99 
 
 
393 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 
410 aa  157  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.85 
 
 
399 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  32.8 
 
 
396 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.15 
 
 
411 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  31.47 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.68 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  35.67 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.8 
 
 
399 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.09 
 
 
405 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2456  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.71 
 
 
418 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.47 
 
 
414 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.7 
 
 
402 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.07 
 
 
407 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 
393 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4246  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.34 
 
 
411 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381159  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34 
 
 
418 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.98 
 
 
424 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 
405 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.9 
 
 
396 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.9 
 
 
396 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.59 
 
 
396 aa  150  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.73 
 
 
403 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.04 
 
 
415 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.95279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.34 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.53 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.34 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.07 
 
 
405 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 
424 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.12 
 
 
425 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.02 
 
 
396 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.02 
 
 
396 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.02 
 
 
396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.06 
 
 
411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.93 
 
 
424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.02 
 
 
396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.25 
 
 
396 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.49 
 
 
400 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.65 
 
 
400 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.01 
 
 
411 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.3 
 
 
398 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.93 
 
 
400 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.77 
 
 
412 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.35 
 
 
406 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  27.3 
 
 
413 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.22 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.22 
 
 
400 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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