More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1175 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  99.76 
 
 		 408 aa  777    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  99.76 
 
 		 408 aa  777    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  99.76 
 
 		 408 aa  777    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  90.35 
 
 		 404 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  99.51 
 
 		 408 aa  776    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  89.85 
 
 		 404 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  99.76 
 
 		 408 aa  777    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  90.35 
 
 		 404 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  82.19 
 
 		 411 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  90.1 
 
 		 404 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  99.76 
 
 		 408 aa  777    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  100 
 
 		 409 aa  808    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  90.1 
 
 		 404 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  61.22 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  60.41 
 
 		 410 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  59.19 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  60.31 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  59.85 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  59.95 
 
 		 403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  60.2 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  60.2 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  61.36 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  44.12 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  48.12 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  47.51 
 
 		 411 aa  356  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  43.6 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  45.84 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  45.84 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  45.59 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  45.59 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  45.59 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  45.59 
 
 		 404 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  45.59 
 
 		 404 aa  345  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  45.34 
 
 		 404 aa  345  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  45.54 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  45.69 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  42.34 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 406 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  44.36 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  42.32 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 431 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  45.27 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  40.55 
 
 		 487 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.95 
 
 		 416 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 420 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 415 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 410 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 407 aa  222  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  35.42 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  32.81 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  35.42 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.02 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.96 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.29 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.33 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.44 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  23.47 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.53 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  23.83 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.8 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.8 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.42 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  23.71 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  23.28 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.09 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.76 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>