More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1894 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  100 
 
 
431 aa  816    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 
403 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
435 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  38 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  42.29 
 
 
405 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
403 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  42 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  38.97 
 
 
421 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  39.21 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  39.21 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  39.21 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
401 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  40.14 
 
 
420 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
422 aa  200  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  36.73 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  28.94 
 
 
387 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.3 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.88 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  28.22 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.06 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  21.27 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26513  MFS family transporter: multidrug efflux  23.58 
 
 
442 aa  77  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0853382  normal  0.0548675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  34.64 
 
 
424 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.69 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.88 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  36.84 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.51 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.58 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.97 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  26.7 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.19 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.65 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.52 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  35.37 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  28.8 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  24.35 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  25.47 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.73 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  20.73 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  23.98 
 
 
387 aa  67  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  21.64 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  21.77 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.46 
 
 
447 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  21.99 
 
 
505 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.33 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
553 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  22.51 
 
 
453 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.59 
 
 
506 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  33.55 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.65 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  21.86 
 
 
400 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  25.27 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  25.64 
 
 
552 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
413 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.43 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  34.88 
 
 
456 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.06 
 
 
387 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  21.9 
 
 
400 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25.87 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
503 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  26.32 
 
 
446 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  25.79 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 
522 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
442 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.11 
 
 
517 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  24.55 
 
 
381 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  35.66 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  27.05 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  27.88 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  34.11 
 
 
456 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.3 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  25.19 
 
 
387 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  25.19 
 
 
387 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>