More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0648 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  794    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  56.46 
 
 
403 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  56.46 
 
 
403 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  56.46 
 
 
403 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  56.27 
 
 
393 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  56.02 
 
 
406 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  53.54 
 
 
446 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  55.03 
 
 
404 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  59.01 
 
 
416 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  54.4 
 
 
417 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  58.4 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  52.84 
 
 
402 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  51.78 
 
 
408 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  51.93 
 
 
407 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  51.26 
 
 
568 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  52.62 
 
 
565 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  49.61 
 
 
431 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  55.68 
 
 
424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 
428 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  38.61 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  38.32 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 
385 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  38.61 
 
 
387 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  38.61 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  38.33 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  38.33 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  38.33 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  38.33 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  38.89 
 
 
387 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  38.32 
 
 
387 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  36.76 
 
 
381 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  43.11 
 
 
368 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
402 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.08 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 
511 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.94 
 
 
503 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.19 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.94 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
497 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 
517 aa  67  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 
508 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 
525 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  28.19 
 
 
526 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 
512 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 
513 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.01 
 
 
510 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 
513 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 
502 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 
466 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 
508 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.4 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.45 
 
 
512 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 
486 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  31.82 
 
 
469 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.79 
 
 
565 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.36 
 
 
509 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 
526 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 
469 aa  63.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1409  major facilitator transporter  26.69 
 
 
462 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  28.18 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  31.85 
 
 
492 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  31.48 
 
 
491 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  31.17 
 
 
476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  27.09 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  31.17 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  31.17 
 
 
476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  28.18 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000024134  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  28.18 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 
518 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 
522 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 
527 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 
527 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 
508 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  27.65 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 
413 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 
509 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  29.58 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
579 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.96 
 
 
512 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  28.31 
 
 
466 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 
504 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>