More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2789 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  100 
 
 
568 aa  1087    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  63.13 
 
 
565 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  58.79 
 
 
402 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  57.47 
 
 
407 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  60.1 
 
 
408 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  56.45 
 
 
403 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  56.45 
 
 
403 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  56.45 
 
 
403 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  52.19 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  59.73 
 
 
407 aa  352  7e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  54.15 
 
 
404 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 
402 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  54.18 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  49.62 
 
 
446 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  53.69 
 
 
416 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  53.13 
 
 
440 aa  325  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  52.51 
 
 
406 aa  319  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 
412 aa  317  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  49.86 
 
 
417 aa  302  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 
422 aa  300  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  46.75 
 
 
431 aa  280  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 
428 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  40.33 
 
 
387 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  40.05 
 
 
387 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  40.11 
 
 
387 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 
385 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  39.51 
 
 
387 aa  249  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  39.24 
 
 
387 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  39.24 
 
 
387 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  39.24 
 
 
387 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  39.24 
 
 
387 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  54.01 
 
 
424 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  39.57 
 
 
387 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  39.57 
 
 
387 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  38.59 
 
 
381 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  42.47 
 
 
368 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
402 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
393 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
393 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  25.36 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  27.44 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  25.37 
 
 
393 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  26.04 
 
 
561 aa  67  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 
517 aa  65.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.04 
 
 
511 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  25.96 
 
 
392 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
521 aa  65.1  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
511 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.61 
 
 
510 aa  64.3  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  24.57 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.12 
 
 
534 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.14 
 
 
526 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.61 
 
 
526 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  23.77 
 
 
393 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 
509 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 
529 aa  61.2  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  25.14 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  25.22 
 
 
393 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.15 
 
 
393 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 
525 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 
532 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
511 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
527 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
527 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  26.14 
 
 
526 aa  60.1  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 
513 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.61 
 
 
520 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.58 
 
 
508 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.18 
 
 
511 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.17 
 
 
514 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.24 
 
 
391 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 
524 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.9 
 
 
461 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 
627 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  24.43 
 
 
394 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.91 
 
 
485 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.23 
 
 
510 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
497 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
403 aa  57.4  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.23 
 
 
503 aa  57.4  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
463 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  28.22 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28.73 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
460 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 
512 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
609 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
513 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.65 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  27.88 
 
 
1065 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 
508 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
520 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
476 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.22 
 
 
399 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
486 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 
525 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>