More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1563 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  793    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  59.07 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  57.82 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  58.23 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  57.29 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  57.51 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  52 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  52 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  53.21 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  56.92 
 
 		 408 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  54.38 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  55.47 
 
 		 407 aa  312  9e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  53.48 
 
 		 568 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 565 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  50.75 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 417 aa  302  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 		 412 aa  296  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  43.79 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 428 aa  255  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  38.5 
 
 		 387 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  38.23 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  38.23 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  38.23 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  37.95 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  37.95 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  37.95 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  37.95 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  37.95 
 
 		 387 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  44.25 
 
 		 368 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.17 
 
 		 545 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 514 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.99 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  37.58 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 		 541 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.23 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.57 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.94 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1409  major facilitator transporter  25 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.61 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.13 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.69 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  31.86 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  23.86 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.21 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  25 
 
 		 462 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 525 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.62 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.28 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 539 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.64 
 
 		 532 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>