More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1255 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
385 aa  764    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  65.18 
 
 
387 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  65.18 
 
 
387 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  65.18 
 
 
387 aa  484  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  65.18 
 
 
387 aa  484  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  65.78 
 
 
387 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  65.18 
 
 
387 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  65.36 
 
 
387 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  68.72 
 
 
387 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  67.95 
 
 
387 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  65.62 
 
 
387 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  64.27 
 
 
381 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  41.29 
 
 
403 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  41.29 
 
 
403 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  41.57 
 
 
568 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  41.01 
 
 
403 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  40.73 
 
 
393 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
386 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 
402 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
407 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  41.18 
 
 
404 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  43.84 
 
 
368 aa  245  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  42.27 
 
 
565 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  42.34 
 
 
406 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  39.68 
 
 
446 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  40.53 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  41.38 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
402 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  38.38 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 
407 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
412 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
422 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  40.16 
 
 
431 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
428 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
424 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
406 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  26.11 
 
 
393 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  26.11 
 
 
393 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  25.56 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  25.9 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  25 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  27.75 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.52 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  24.72 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.64 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  29.73 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  24.87 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 
522 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  24.72 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.86 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  24.17 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  29.47 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.42 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0553  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00432944  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  29.17 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  25.53 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  25.2 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  31 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  24.93 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  24.93 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 
516 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.62 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  24.93 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.12 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
562 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  32.32 
 
 
444 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.68 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  32.61 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.68 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  24.93 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.75 
 
 
526 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 
525 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  33.12 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  28.75 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.17 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.14 
 
 
519 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.11 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.9 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  27.58 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 
525 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.09 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  31.55 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.56 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  25.34 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 
466 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>