More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3781 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  89.58 
 
 
408 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
407 aa  780    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  64.27 
 
 
407 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  67.36 
 
 
402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  60.78 
 
 
568 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  59.89 
 
 
565 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  51.63 
 
 
402 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  55.62 
 
 
403 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  55.62 
 
 
403 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  57.85 
 
 
416 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  54.12 
 
 
393 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  55.62 
 
 
403 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  57.41 
 
 
412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  57.3 
 
 
404 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  55.18 
 
 
417 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  52.96 
 
 
446 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  55.99 
 
 
440 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  54.52 
 
 
406 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  52.39 
 
 
386 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  50.49 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
422 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  58.16 
 
 
424 aa  276  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  41.82 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  42.36 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  42.36 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  41.82 
 
 
387 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  41.82 
 
 
387 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  41.55 
 
 
387 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  41.55 
 
 
387 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  41.55 
 
 
387 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  41.55 
 
 
387 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  41.55 
 
 
387 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 
385 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  40.82 
 
 
381 aa  233  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  41.02 
 
 
368 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
402 aa  176  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  31.21 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 
512 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.5 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.55 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 
509 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.02 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 
511 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  27.4 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.6 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  29.45 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.4 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.52 
 
 
540 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.55 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.27 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
541 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.51 
 
 
526 aa  67.4  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.06 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 
609 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.06 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 
513 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  31.38 
 
 
528 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 
525 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 
529 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  27.51 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 
511 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 
511 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.09 
 
 
513 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 
627 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  29.9 
 
 
471 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  30.22 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.47 
 
 
526 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 
521 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  27.03 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.03 
 
 
514 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.09 
 
 
513 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.73 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  31.87 
 
 
476 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.04 
 
 
478 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  31.87 
 
 
476 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.17 
 
 
520 aa  63.5  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 
503 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  28.93 
 
 
414 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.42 
 
 
527 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.06 
 
 
407 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>