More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4405 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  88.65 
 
 
423 aa  675    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  88.65 
 
 
423 aa  675    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  100 
 
 
421 aa  814    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  88.65 
 
 
423 aa  675    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  85.23 
 
 
440 aa  727    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  52.2 
 
 
403 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 
435 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  52.53 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  52.47 
 
 
405 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  50.9 
 
 
420 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  45.65 
 
 
434 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  51.01 
 
 
422 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  45.36 
 
 
400 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 
403 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  38.97 
 
 
431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.42 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  27.13 
 
 
399 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  27.13 
 
 
505 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
395 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  27.18 
 
 
400 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  27.18 
 
 
400 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  27.06 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  26.93 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.42 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  27.06 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  27.06 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  27.06 
 
 
506 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
422 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.68 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.91 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  28.57 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
390 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.19 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.23 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 
537 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.56 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  32.4 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30.12 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.81 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  22.94 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.5 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 
528 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.45 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  37.6 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.14 
 
 
523 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.37 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2610  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.19 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.37 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.41 
 
 
496 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.31 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  37.6 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  37.6 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  37.6 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  37.6 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  27.15 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  27.15 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  26.15 
 
 
467 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  36.8 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  36.8 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  36.8 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  36.8 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  36.8 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  25.71 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  25.45 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.41 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.93 
 
 
504 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  23.96 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.9 
 
 
539 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  30.26 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.06 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>