More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0552 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  791    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  49.62 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  42.55 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 406 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  28 
 
 		 395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25.35 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.37 
 
 		 409 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.04 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.79 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.79 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.91 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.91 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.04 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  28.12 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0906  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0319355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.36 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  28.99 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.71 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  26.72 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.19 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4356  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  27.13 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.66 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  23.23 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  23.23 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  22.93 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.16 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  25.77 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  23.16 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  23.16 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.96 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  23.16 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  23.16 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1386  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.594159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  22.88 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  22.88 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>