208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2822 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  808    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  56.59 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 420 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  54.24 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 432 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  29.5 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  30.15 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  29.19 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 		 424 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  29.47 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  29.67 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  29.07 
 
 		 423 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  29.07 
 
 		 423 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  29.07 
 
 		 423 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  29.07 
 
 		 423 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  29.57 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.73 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  28.64 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  28.24 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  28.75 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  29.55 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  27.65 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  28.46 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  28.57 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  28.88 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  29.45 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  28.23 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  27.87 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  28.44 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  27.3 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  28.39 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  27.18 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  26.55 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  27.16 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  27.16 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  28.61 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  26.62 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  25.76 
 
 		 428 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  25.43 
 
 		 425 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  27.08 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  28.95 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  26.4 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  27.04 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  24.36 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  26.43 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  26.63 
 
 		 439 aa  106  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  26.41 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  26.72 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  27.2 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1218  Fucose permease-like protein  55.75 
 
 		 158 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  26.5 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_002950  PG2170  sugar transporter  26.16 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  23.56 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  25 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  23.21 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  24.82 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  27.54 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  24.36 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  23.37 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.67 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  23.62 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  24.37 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  26.88 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  23.5 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.64 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  26.42 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  25.51 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  24.76 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  26.94 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.65 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  25.18 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  24.81 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  24.73 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  23.19 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  22.91 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  24.61 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  23.8 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  25.56 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  23.41 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  24.72 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.73 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  22.44 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  25.06 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  24.52 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.36 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>