82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1218 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1218  Fucose permease-like protein  100 
 
 		 158 aa  304  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  93.81 
 
 		 419 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  63.96 
 
 		 421 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  55.75 
 
 		 415 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  51.67 
 
 		 420 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 		 420 aa  121  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  53.39 
 
 		 425 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 447 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 432 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 432 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  45.54 
 
 		 432 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  44.05 
 
 		 435 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  39.05 
 
 		 435 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  45.78 
 
 		 431 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  43.02 
 
 		 435 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  44.58 
 
 		 431 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  44.58 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  40.71 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  40.91 
 
 		 436 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  40.71 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  45.24 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  43 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  43 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  42.5 
 
 		 421 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  41.67 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  40 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  39.53 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  42.86 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  42.86 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  36.84 
 
 		 424 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  41.25 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  42.86 
 
 		 423 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  42.86 
 
 		 423 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  39.78 
 
 		 428 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  42.5 
 
 		 428 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  38.1 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  36.26 
 
 		 458 aa  57.4  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  34.41 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  39.53 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  40 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  37.37 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  42.86 
 
 		 407 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  32.46 
 
 		 408 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  32.17 
 
 		 428 aa  54.3  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  34.34 
 
 		 426 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  31.48 
 
 		 408 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  34.44 
 
 		 426 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  50 
 
 		 426 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  34.12 
 
 		 468 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  36.71 
 
 		 440 aa  52.4  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  34.83 
 
 		 429 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  34.91 
 
 		 425 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  39.39 
 
 		 485 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  34.58 
 
 		 406 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 413 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  40.28 
 
 		 429 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  30.85 
 
 		 412 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.86 
 
 		 431 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 		 431 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 412 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  35.71 
 
 		 429 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  31.09 
 
 		 441 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33 
 
 		 389 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  34.82 
 
 		 429 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 		 471 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6561  putative transmembrane transporter  29.52 
 
 		 556 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  35 
 
 		 403 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  30.69 
 
 		 413 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  30.97 
 
 		 413 aa  43.9  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  37.68 
 
 		 431 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  30.59 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  30.14 
 
 		 409 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 415 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  29.63 
 
 		 417 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 421 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 		 468 aa  42.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  33.75 
 
 		 405 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  38.89 
 
 		 408 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  35.29 
 
 		 417 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  29.11 
 
 		 440 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>