229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1398 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  96.99 
 
 		 432 aa  781    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  97.92 
 
 		 432 aa  789    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  97.69 
 
 		 447 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 425 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  46.78 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 		 415 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  27.25 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  26.98 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  28.43 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  26.38 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  27.55 
 
 		 440 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  27.58 
 
 		 410 aa  96.3  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  28.09 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  25.43 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  27.06 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  26.29 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  24.7 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.43 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  26.02 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  26.02 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  26.02 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  26.02 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  25.79 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  25.71 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  23.31 
 
 		 438 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  23.06 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  23.06 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  25.63 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  27.86 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  23.06 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  23.06 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1218  Fucose permease-like protein  42.34 
 
 		 158 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  23.06 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  27.75 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  25.9 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  26.41 
 
 		 423 aa  87  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  27.35 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  27.35 
 
 		 415 aa  86.3  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  27.12 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25.47 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.12 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  24.13 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  24.13 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  24.13 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  27.27 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  24.13 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  24.75 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  24.13 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  24.88 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  26.47 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  29.06 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  26.53 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  21.74 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  26.06 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  29.41 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  27.54 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  25.27 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  26.72 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  25 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  24.16 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  26.93 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  26.96 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  26.32 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.81 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0849  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.18 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  26.81 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  25.74 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  26.51 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26.43 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2170  sugar transporter  24.48 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.78 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  24.67 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  25.88 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  26.88 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  24.67 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  26.54 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  24.26 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.99 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  27.78 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  27.47 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  26.86 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  25.14 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  26.84 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>