More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3964 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  100 
 
 		 407 aa  806    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  52.36 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  54.68 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 406 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  54.94 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  55.84 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  55.44 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  55.7 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  46.12 
 
 		 405 aa  328  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  28.99 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  24.88 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  25.46 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.88 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  25.13 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  24.61 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  24.44 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  24.68 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  27 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  25.07 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  25.26 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  24.08 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  24.14 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  24.93 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.13 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  23.34 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  23.59 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  26.26 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  22.91 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.3 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  23.47 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.3 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.72 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  28 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  28 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  22.31 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  30.14 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.53 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  22.48 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  22.45 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  22.45 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  22.45 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  22.45 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 476 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  22.19 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  24.8 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  25 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.44 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  22.6 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.23 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  25.07 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  25 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>