More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0062 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  99.51 
 
 		 406 aa  814    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  98.28 
 
 		 406 aa  803    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  817    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 406 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  86.14 
 
 		 406 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  83 
 
 		 406 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  86.39 
 
 		 406 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  99.01 
 
 		 406 aa  807    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  54.68 
 
 		 407 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 425 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  52.41 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  52.75 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  25.64 
 
 		 415 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25.4 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 420 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.99 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.79 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26.79 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.45 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.36 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.54 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  26.81 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  26.81 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.15 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  24.85 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.06 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  25.29 
 
 		 893 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  20.39 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  22 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  23.81 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.44 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.44 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.44 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  25 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.44 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  27.44 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  24.01 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.52 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  24.74 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.06 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  27.84 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  22.94 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  23.06 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  21.71 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.63 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  25.96 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  22.16 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>