More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6132 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  86.85 
 
 		 403 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6449  major facilitator transporter  87.1 
 
 		 406 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5584  major facilitator transporter  87.34 
 
 		 406 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  96.87 
 
 		 383 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5948  major facilitator transporter  87.34 
 
 		 406 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0185  major facilitator superfamily MFS_1  64.81 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.73097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1427  major facilitator transporter  50.27 
 
 		 445 aa  342  9e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.08987  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4416  major facilitator transporter  55.42 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  52.6 
 
 		 404 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2421  major facilitator superfamily MFS_1  50.76 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.107516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  32.26 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  24.62 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3939  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  22 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1292  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0269507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  23.48 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  24.87 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.42 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  25 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  25 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.99 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  20.16 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2920  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  0.655639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 441 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  22.3 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  24.54 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>