169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1115 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
393 aa  761    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  54.95 
 
 
392 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  58.4 
 
 
414 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  51.7 
 
 
386 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  53.09 
 
 
408 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  47.44 
 
 
394 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  48.21 
 
 
394 aa  386  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  52.19 
 
 
393 aa  383  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 
394 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  44.39 
 
 
389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  47.19 
 
 
326 aa  259  7e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  38.87 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  32.81 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  29.68 
 
 
395 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
394 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  29.44 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  28.19 
 
 
414 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  25.37 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  27.95 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  23.22 
 
 
440 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
392 aa  63.2  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  23.01 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  35.06 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  26.55 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  25.31 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  23.51 
 
 
397 aa  60.1  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.55 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.84 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  24.93 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  25.68 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  24.93 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  23.63 
 
 
397 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  25.86 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
395 aa  57.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.57 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.61 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  27.56 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  24.93 
 
 
385 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.33 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  25.37 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  27.09 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
390 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  25.32 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  26.51 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  27.81 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  20.47 
 
 
505 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  27.41 
 
 
447 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  26.3 
 
 
389 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.61 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.61 
 
 
406 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  26.02 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
385 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 
470 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  26.45 
 
 
404 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  21.65 
 
 
405 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.93 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  24.01 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  27.15 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  23.75 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  23.75 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
388 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.57 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.61 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  28.24 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  25.73 
 
 
378 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 
397 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  27.03 
 
 
376 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
435 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  27.38 
 
 
441 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.24 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  25.61 
 
 
404 aa  49.7  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  25.73 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  25.73 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  25.73 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  24.59 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  25.73 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  25.73 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>