181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0309 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
394 aa  790    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  52.94 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  52.88 
 
 
386 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  52.47 
 
 
394 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 
388 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  52.99 
 
 
394 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  48.08 
 
 
393 aa  360  4e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  45.79 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  47.65 
 
 
393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  48.45 
 
 
389 aa  349  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  44.42 
 
 
408 aa  335  1e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  49.03 
 
 
326 aa  292  8e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  38.86 
 
 
390 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  33.42 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
425 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  33.05 
 
 
395 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
407 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  22.22 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  22.76 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  23.56 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  23.06 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  22.16 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.99 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.65 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  22.52 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.07 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.82 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.96 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.48 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  21.78 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.27 
 
 
505 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.64 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  27.98 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  30.14 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  24.03 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  23.17 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  21.73 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.62 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.1 
 
 
406 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  22.31 
 
 
407 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  25.74 
 
 
407 aa  53.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  24.56 
 
 
406 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  24.13 
 
 
406 aa  53.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  24.25 
 
 
274 aa  53.1  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  24.13 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  25.27 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.88 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  22.32 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2837  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
398 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  20.33 
 
 
433 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  24.73 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.97 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.34 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  25.29 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  26.49 
 
 
425 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  23.76 
 
 
529 aa  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  21.69 
 
 
415 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 
378 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.66 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  26.49 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  23.18 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.72 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.21 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  22.6 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  23.19 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  19.67 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 
429 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  21.08 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 
421 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2345  major facilitator transporter  21.29 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.205861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
402 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  22.8 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
386 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  21.65 
 
 
460 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 
398 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  23.81 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1999  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
424 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000199597  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  21.43 
 
 
414 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1533  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0291496 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  23.58 
 
 
419 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1855  hypothetical protein  25.39 
 
 
365 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  24.58 
 
 
385 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  28.08 
 
 
383 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  30.39 
 
 
409 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 
401 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  20.93 
 
 
400 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  24.44 
 
 
405 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
415 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>