132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1662 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 388 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 		 394 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  49.58 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  46.78 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  46.31 
 
 		 408 aa  358  9e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  55.19 
 
 		 326 aa  332  9e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.82 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  22.77 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  23.96 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.28 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.52 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.15 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  23.15 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  23.15 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.23 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.23 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 427 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  20.78 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  23.88 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.32 
 
 		 529 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  22.03 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  25.76 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  24 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  23.23 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  20.23 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.64 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  23.37 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  23.1 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  23.34 
 
 		 447 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  23.1 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  23.1 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  24.1 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  24.1 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  22 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  22.82 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.7 
 
 		 274 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  25.2 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  22.53 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  22.53 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  23.74 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  22.37 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  20.87 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  22.42 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  22.25 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.06 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>