64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1174 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  773    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 392 aa  365  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  45.95 
 
 		 394 aa  345  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  45.5 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  45.25 
 
 		 414 aa  328  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  42.18 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  28.27 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  25 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  23.21 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  26.35 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  26.35 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  26.35 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  24.44 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  24.83 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  21.88 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  20.91 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  23.96 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  23.27 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  23.78 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  23.33 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  22.18 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.29 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.29 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  23.92 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.39 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25.52 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.52 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  25.6 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  24.75 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  24 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  24 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  24 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  24 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  24 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>