43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1959 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1959  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
386 aa  712    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0139885  hitchhiker  0.0025051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.27 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  26.94 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  28.4 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  28.15 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  26.84 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  26.01 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  27.66 
 
 
386 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  25.33 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  30.75 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  28.84 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
394 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  21.73 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  25.96 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.74 
 
 
388 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.74 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  28.28 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  21.56 
 
 
394 aa  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  25.84 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  24.07 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.89 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  26.64 
 
 
326 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
405 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  24.65 
 
 
529 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  27.71 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  29.01 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  26.76 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  28.71 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.1 
 
 
386 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
354 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  32.19 
 
 
384 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  28.83 
 
 
474 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  30.58 
 
 
1829 aa  43.1  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>