48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01310 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1093    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  31.53 
 
 
433 aa  209  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  30.1 
 
 
507 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  31.17 
 
 
417 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  29.33 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  29.73 
 
 
444 aa  180  7e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  28.94 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  30.79 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  30.9 
 
 
419 aa  160  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.77 
 
 
505 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  25 
 
 
274 aa  97.8  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  24.74 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.46 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  22.95 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  22.66 
 
 
436 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  24.74 
 
 
408 aa  60.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  22.52 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
425 aa  58.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  22.65 
 
 
386 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  22.95 
 
 
394 aa  57  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
388 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  25.25 
 
 
395 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  23.97 
 
 
394 aa  55.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  21.71 
 
 
393 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.01 
 
 
395 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
394 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  22.35 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  22.35 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  22.35 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  22.35 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  22.35 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  23.04 
 
 
420 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  25.59 
 
 
457 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  21.94 
 
 
403 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 
393 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  23.18 
 
 
431 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  27.03 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  22.43 
 
 
423 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  22.25 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  22.15 
 
 
428 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  22.51 
 
 
390 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  23.34 
 
 
431 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  22.36 
 
 
389 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  27.41 
 
 
415 aa  43.9  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 
444 aa  43.5  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  21.51 
 
 
435 aa  43.5  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>