54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31239 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  100 
 
 		 507 aa  1046    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  68.47 
 
 		 444 aa  622  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  65.17 
 
 		 433 aa  617  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  45.72 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  37.29 
 
 		 274 aa  209  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 		 529 aa  206  7e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  29.8 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  28.71 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  29.21 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  31.76 
 
 		 474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  27.93 
 
 		 411 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  25.73 
 
 		 505 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  26.88 
 
 		 391 aa  86.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 395 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.14 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  21.1 
 
 		 407 aa  57  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.57 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  22.15 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 392 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  22.5 
 
 		 426 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  24.02 
 
 		 398 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  22.51 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  22.27 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  23.15 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  23.15 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  23.15 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  23.15 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  22.25 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  21.62 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  20.62 
 
 		 403 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  21.99 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  27.78 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  20.9 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1549  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  22.31 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  20.75 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  20.47 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  22.15 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  21.3 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  22 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  22.35 
 
 		 400 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 394 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  20.92 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>