31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1549 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1549  major facilitator transporter  100 
 
 		 363 aa  702    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0816  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.14 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  26.54 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  26.81 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 406 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23.63 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  23.65 
 
 		 507 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  24.44 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  20.29 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  23.66 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  19.32 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  21.89 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  22.37 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2822  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 415 aa  42.7  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  22.79 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>