52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_45095 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  100 
 
 		 433 aa  882    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  65.17 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  62.84 
 
 		 444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  46.65 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  38.33 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  31.57 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  31.53 
 
 		 529 aa  209  6e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  30.57 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  31.37 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  28.82 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  27.16 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  25.11 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 395 aa  97.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.25 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  21.82 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  25.94 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  22.79 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  23.32 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  21.78 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 394 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25.81 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  23.2 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1549  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 363 aa  53.9  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.42 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  23.43 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.76 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  22.02 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 390 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  22.64 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  26.34 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  23.4 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  23.22 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  23.55 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  19.77 
 
 		 391 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  23.37 
 
 		 412 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>