56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59269 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  100 
 
 		 444 aa  905    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  68.47 
 
 		 507 aa  666    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  62.84 
 
 		 433 aa  611  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  46.08 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  38.98 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  32.01 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  29.36 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  27.8 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  26.53 
 
 		 411 aa  152  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  25 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  26.75 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  22.84 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  22.88 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  23.8 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  21.67 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.3 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  20.67 
 
 		 388 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.19 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.58 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  22.7 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  23.5 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  24.2 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  23.93 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  24.2 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  22.25 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  21 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  22.12 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  22.12 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  24.43 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  20.9 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  21.26 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  22.58 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  31.45 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  20.48 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  21.52 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  24.59 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  22.32 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  20.09 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>