99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1163 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  730    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  26.12 
 
 		 433 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  26.08 
 
 		 505 aa  116  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  27.46 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  26.45 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  25 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  26.88 
 
 		 507 aa  100  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  28.65 
 
 		 414 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  26.16 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  24.87 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 529 aa  93.6  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  28.01 
 
 		 474 aa  93.2  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  25.27 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 415 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  28.25 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  26.71 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  19.95 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  19.95 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  21.22 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  21.22 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  20.93 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23.81 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25.95 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  23.24 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.6 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.87 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  23.4 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  20.46 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  24.05 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  26.67 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 386 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  20.85 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  20.29 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  22.16 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.95 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  25.83 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.86 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0417  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 447 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 447 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  24.65 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  23.37 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  24.46 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 456 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>