137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2507 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  89.03 
 
 
415 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  91.47 
 
 
416 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  91.52 
 
 
416 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  89.53 
 
 
415 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  85.57 
 
 
416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  71.61 
 
 
391 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  74.47 
 
 
408 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  73.15 
 
 
415 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  37.23 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  40.49 
 
 
411 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  35.9 
 
 
398 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  38.29 
 
 
395 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 
380 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  37.79 
 
 
388 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  38.3 
 
 
389 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
395 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  38.3 
 
 
389 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  33.07 
 
 
393 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  37.23 
 
 
399 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  32.31 
 
 
392 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  29.58 
 
 
400 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  31.88 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  26.63 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  28.36 
 
 
428 aa  90.5  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  34.2 
 
 
404 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  30.48 
 
 
394 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  27.89 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.92 
 
 
359 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  31.66 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  29.55 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  31.9 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  26.3 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  28.22 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  31.48 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  27.37 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.92 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  29.28 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  29.25 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  31.66 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  31.97 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  27.86 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  30.81 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  29.61 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  30.14 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  33.78 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  29.8 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  31.58 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  24.36 
 
 
395 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  29.03 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  27.03 
 
 
388 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  23.82 
 
 
433 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  24.64 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  30.31 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  28.65 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  29.59 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  28.38 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  24.18 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  29.85 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 
413 aa  60.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  31.56 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  31.76 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  28.73 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  27.69 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  29.14 
 
 
390 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  28.29 
 
 
405 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  35.33 
 
 
417 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  29.92 
 
 
422 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  27.38 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
399 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  34.76 
 
 
394 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  32.08 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  35.29 
 
 
441 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  34.92 
 
 
439 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  30.04 
 
 
395 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  36.18 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  28.19 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  26.57 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  28.46 
 
 
386 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  29.58 
 
 
405 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  36.55 
 
 
420 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  29.01 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  27.68 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  28.87 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  27.25 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  27.38 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  26.21 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  27.38 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  32.7 
 
 
409 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  27.11 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  27.83 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  27.83 
 
 
394 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27.32 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  27.71 
 
 
402 aa  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>