117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0805 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  772    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  84.24 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  83.74 
 
 		 404 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  61.24 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  54 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  59.07 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  54.3 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  58.22 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  56.3 
 
 		 417 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  50.9 
 
 		 408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  50.25 
 
 		 417 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  49.87 
 
 		 408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0273  hypothetical protein  59.36 
 
 		 427 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  50.9 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  50.26 
 
 		 413 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  52.59 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  52.59 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  50.66 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  48.63 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  53.33 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  52.71 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  47.04 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  35.77 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  39.73 
 
 		 390 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  60.26 
 
 		 504 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  38.86 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  36.27 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2659  major facilitator transporter  61.49 
 
 		 540 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  34.91 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  38.25 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  64.93 
 
 		 546 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  64.93 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  64.18 
 
 		 525 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  35.71 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  39.82 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  37.98 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  38.66 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  34.83 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  34.43 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  44.67 
 
 		 238 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  44.67 
 
 		 238 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  44.67 
 
 		 238 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  35.57 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 403 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  30 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  33.67 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  31.33 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  34.39 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  27.48 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  34.11 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  28.29 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  31.62 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  31.59 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  31.35 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  29.56 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  34.49 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  34.49 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  29.28 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  32 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  29.54 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  29.54 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  29.54 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  29.97 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  34.2 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  34.2 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  31.48 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  33.62 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  29.95 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  29.97 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  30.25 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  32.26 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  32.04 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  30.79 
 
 		 443 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  29.44 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>