130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3120 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  100 
 
 		 394 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  91.37 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  54.89 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  56.06 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  50.67 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  45.53 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  36.99 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  36.99 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  36.71 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  34.82 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  30.73 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  35.95 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  36.99 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  34.54 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  30.73 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  33.79 
 
 		 392 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  33.79 
 
 		 392 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  33.79 
 
 		 392 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  34.99 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  37.17 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  34.47 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  34 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  32.75 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  28.46 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  32.19 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  36.67 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  33.67 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  29.72 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  32.01 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  26.42 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  31.62 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  32.52 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  32.28 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  34.41 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  33.8 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  32.36 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  32.9 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  35.03 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  32.79 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  34.32 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  30.13 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  34.72 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  31.81 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  31.95 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  32.12 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  33.68 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  36.19 
 
 		 405 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  32.71 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  29.09 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  31.32 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  31.18 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  32.88 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  32.78 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  30.58 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  33.88 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  31.97 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 385 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0330  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.422618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0308  hypothetical protein  34.27 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  31.5 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 415 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  31.28 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  30.75 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0273  hypothetical protein  31.92 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  32.93 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  27.11 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0319  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0621236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  32.83 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  39.62 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  32.41 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  37.58 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>