114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0929 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  788    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  96.53 
 
 		 420 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  87.22 
 
 		 417 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  85.39 
 
 		 408 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  86.11 
 
 		 413 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  83.12 
 
 		 437 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  63.75 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  66.4 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  58.02 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  52.23 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  50.13 
 
 		 404 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  50.66 
 
 		 404 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  53.49 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  46.7 
 
 		 423 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  51.05 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  50.79 
 
 		 422 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  49.14 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  50.13 
 
 		 417 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0273  hypothetical protein  49.43 
 
 		 427 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  42.53 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  76.19 
 
 		 546 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  75.66 
 
 		 537 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  75.66 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  39.8 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  67.24 
 
 		 504 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  69.03 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  69.03 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  69.03 
 
 		 238 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2659  major facilitator transporter  68.12 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  32.04 
 
 		 385 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  34.44 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  32.82 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  33.51 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2471  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2569  hypothetical protein  31.66 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1449  hypothetical protein  34.09 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  35.13 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  36.45 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  32.96 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  34.44 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1384  hypothetical protein  35.49 
 
 		 390 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0951204  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1651  hypothetical protein  32.89 
 
 		 388 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0231704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3928  hypothetical protein  35.83 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3819  hypothetical protein  34.46 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0125429  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  31.12 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  31.93 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  30.85 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  32.19 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  28.01 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  30.29 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  30.29 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  32.03 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  31.93 
 
 		 394 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  27.23 
 
 		 395 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  31.83 
 
 		 394 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  27.83 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  33 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  31.02 
 
 		 392 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 433 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  30.52 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  27.67 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  30.83 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  32 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45070  hypothetical protein  32.99 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  32.88 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  31.71 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  29.02 
 
 		 400 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  33.99 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  29.02 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.39 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  28.38 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  27.87 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  37.88 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  38.32 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0319  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 402 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0621236  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  35 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>