222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1918 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  100 
 
 		 386 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  61.29 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  58.18 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  58.59 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  49.08 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  51.1 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  50.79 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  32.86 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  34.45 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  33.15 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  33.15 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  33.15 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  33.15 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  33.15 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  32.96 
 
 		 384 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  32.78 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  33.52 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  32.11 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  30.65 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  30.65 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  31.83 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  30.19 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  31.63 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  25.6 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  29.56 
 
 		 385 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  24.85 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.2 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.2 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  28.33 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 446 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 446 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 446 aa  96.3  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 464 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  25 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 443 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  25 
 
 		 438 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  26.29 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  24.65 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 		 480 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 480 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 480 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  24.7 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 480 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 444 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 476 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 447 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 420 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 474 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  25.47 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  26.02 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>