247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00909 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  100 
 
 
382 aa  758    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
382 aa  758    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  88.22 
 
 
382 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  88.22 
 
 
382 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  100 
 
 
382 aa  758    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  87.96 
 
 
382 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  99.48 
 
 
382 aa  755    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  99.74 
 
 
382 aa  756    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  99.74 
 
 
382 aa  756    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  100 
 
 
382 aa  758    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  88.22 
 
 
382 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  88.22 
 
 
382 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  758    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  83.46 
 
 
382 aa  618  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  67.99 
 
 
381 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  65.71 
 
 
382 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 
382 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 
384 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 
382 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  62.57 
 
 
384 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  61.94 
 
 
396 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  47.66 
 
 
384 aa  353  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  32.14 
 
 
386 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  31.55 
 
 
356 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  27.84 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  32.39 
 
 
389 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  30.03 
 
 
389 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  28.77 
 
 
411 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  30.11 
 
 
434 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  29.65 
 
 
389 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  30.29 
 
 
384 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  29.83 
 
 
434 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  32.63 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  32.93 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  31.29 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  32.63 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  28.8 
 
 
476 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  31.59 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  28.8 
 
 
476 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  31.32 
 
 
431 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  32.63 
 
 
388 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  31.59 
 
 
390 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.08 
 
 
474 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  29.08 
 
 
474 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.74 
 
 
452 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  28.53 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  31.91 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  30.57 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  31.58 
 
 
430 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.53 
 
 
480 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  28.53 
 
 
480 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
480 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.42 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  27.48 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  32.53 
 
 
386 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.73 
 
 
520 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  27.82 
 
 
446 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  27.72 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  27.82 
 
 
444 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.55 
 
 
443 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  26.8 
 
 
447 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.4 
 
 
474 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.91 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  29.75 
 
 
471 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.91 
 
 
473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  31.33 
 
 
387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  27.32 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  27.61 
 
 
409 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.76 
 
 
471 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  28.05 
 
 
446 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  28.29 
 
 
436 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
430 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.4 
 
 
459 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  26.59 
 
 
444 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  27.7 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  29.94 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  28.74 
 
 
427 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  28.11 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  29.97 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  27.92 
 
 
438 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.69 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  25.15 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  26.58 
 
 
726 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  26.87 
 
 
408 aa  113  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  31.17 
 
 
443 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26.91 
 
 
713 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.08 
 
 
385 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  29.85 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  28.21 
 
 
412 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.06 
 
 
425 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  28.53 
 
 
415 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  25.27 
 
 
411 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.48 
 
 
446 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.48 
 
 
446 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.48 
 
 
446 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.76 
 
 
412 aa  106  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  27.76 
 
 
420 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
417 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>