214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0613 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  815    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  63.97 
 
 		 418 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  62.01 
 
 		 418 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  62.01 
 
 		 418 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  54.33 
 
 		 424 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  53.63 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  46.7 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  39.15 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 417 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  34.14 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 436 aa  227  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 432 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  36.12 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  35.53 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  35.26 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  33.58 
 
 		 726 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  31.39 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 713 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  33.51 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  30.89 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.51 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  31.11 
 
 		 427 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  35.57 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 444 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.23 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 452 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  28 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  27.5 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.02 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  26.74 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.43 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.27 
 
 		 520 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  24.94 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  24.88 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  25.26 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  26.49 
 
 		 395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 436 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 476 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  27.69 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.93 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 474 aa  126  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 480 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 480 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 480 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  26.29 
 
 		 474 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 439 aa  116  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  26.57 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2511  hypothetical protein  28.76 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>