279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2857 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  77.86 
 
 		 452 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  855    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  75.06 
 
 		 434 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  76.08 
 
 		 434 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  74.71 
 
 		 444 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  74.32 
 
 		 443 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  74.59 
 
 		 473 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  74.71 
 
 		 446 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  75.89 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  73.23 
 
 		 447 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  56.34 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  56.34 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  56.34 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  53.59 
 
 		 464 aa  454  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  58.24 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  57.77 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  53.74 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  52.14 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  52.68 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  52.22 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  52.46 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  51.27 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  50.35 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  49.33 
 
 		 385 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 		 430 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 436 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 409 aa  196  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  33.58 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  31.3 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  30.77 
 
 		 418 aa  170  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  34.62 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  29.35 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  32.69 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  32.55 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  35.87 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  28.86 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  31.51 
 
 		 384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 432 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  27.89 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.41 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  30.08 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  27.6 
 
 		 726 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  30.79 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  26.91 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  26.91 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  32.07 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  30.88 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 713 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  26.85 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  27.72 
 
 		 412 aa  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  30.7 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  29.23 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  28.9 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  28.94 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>