229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3112 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  79.69 
 
 		 474 aa  718    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  76.74 
 
 		 480 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  76.74 
 
 		 480 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  69.78 
 
 		 459 aa  648    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  77.11 
 
 		 476 aa  734    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  77.53 
 
 		 476 aa  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  70.33 
 
 		 474 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  81.5 
 
 		 474 aa  734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  100 
 
 		 520 aa  1055    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  76.74 
 
 		 480 aa  725    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  76.96 
 
 		 480 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  79.87 
 
 		 481 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  51.79 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  52.62 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  52.62 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  53.73 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  51.04 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  51.42 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  50.61 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  50.61 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 446 aa  359  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  47.15 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  42.54 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  36.9 
 
 		 443 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 471 aa  189  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  30.82 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  30.82 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  36.44 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  30.12 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  29.35 
 
 		 410 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 412 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  31.11 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  29.63 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 425 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  33.33 
 
 		 429 aa  160  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  30.14 
 
 		 397 aa  156  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  33.94 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  30.64 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  29.31 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  29.56 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 429 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 454 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  30.11 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.22 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 418 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 418 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  28.26 
 
 		 398 aa  143  9e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  25.46 
 
 		 726 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 713 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.51 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  28.28 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 432 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  29.41 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  29.31 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  26.87 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  27.91 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  27.91 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  29.27 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  27.91 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  27.91 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  27.91 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  28.26 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  26.87 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  30.55 
 
 		 382 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  27.62 
 
 		 382 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  29.85 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>