281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2706 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  100 
 
 		 404 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  65.84 
 
 		 408 aa  550  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  64.93 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  34.65 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  33.33 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  31.32 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  32.48 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  33.07 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  32.48 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 443 aa  186  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  32.88 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  31.9 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  32.49 
 
 		 427 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  37.23 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 430 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  30.34 
 
 		 444 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  30.94 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  31.94 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 471 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 444 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 436 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  29.27 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  29.27 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  28.21 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  30.13 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  30.51 
 
 		 520 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  28.24 
 
 		 407 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 480 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 480 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 480 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  30.24 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.45 
 
 		 385 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 726 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 481 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 476 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  28.95 
 
 		 474 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  32.28 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  24.87 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  27.62 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 432 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 454 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.19 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  27.27 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  26.61 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  26.38 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 713 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2511  hypothetical protein  28.17 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  27.04 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  26 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>