140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2511 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2511  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  671    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  29.11 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 447 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 408 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.24 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 424 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.22 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 421 aa  92.8  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 417 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 471 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  26.92 
 
 		 412 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 418 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  25 
 
 		 411 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  27.36 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  27.86 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  27.86 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 436 aa  82.8  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.3 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 420 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  31.79 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  26.43 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  21.08 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  26.69 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  24.92 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 		 443 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  25.08 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  26.42 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  25.91 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.07 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  24.61 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  22.32 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 480 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 480 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  23.49 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  26.58 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  23.75 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  28.46 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  24.28 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  25.76 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  27.47 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  26.25 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  25.72 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  23.53 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 726 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  22.96 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  22.55 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>