205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3394 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  100 
 
 
388 aa  748    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  88.11 
 
 
388 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  88.11 
 
 
388 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  88.11 
 
 
388 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  87.6 
 
 
388 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  78.55 
 
 
390 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  78.29 
 
 
390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  78.29 
 
 
390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  76.04 
 
 
387 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  60.21 
 
 
390 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  56.99 
 
 
389 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  57.18 
 
 
389 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  56.66 
 
 
389 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  51.32 
 
 
384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  50.66 
 
 
386 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  45.62 
 
 
386 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  46.89 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30 
 
 
411 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  33.52 
 
 
430 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  34.63 
 
 
409 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  34.89 
 
 
412 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  33.85 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  33.03 
 
 
431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  30.53 
 
 
382 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  31.61 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  31.8 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
436 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  30.12 
 
 
384 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  29.91 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  29.91 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  29.91 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  29.91 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  31.35 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  30.22 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  29.65 
 
 
381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  33.54 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  31.56 
 
 
396 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  31.67 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  31.67 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  31.67 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  31.06 
 
 
446 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.36 
 
 
425 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  28.01 
 
 
382 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
417 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  28.01 
 
 
382 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  30.75 
 
 
384 aa  123  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  28.49 
 
 
464 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  29.01 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  29.01 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  27.7 
 
 
415 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  27.54 
 
 
428 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  30 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  29.73 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  29.45 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  31.31 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
430 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.6 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  28.22 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  29.97 
 
 
452 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.4 
 
 
459 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  28.65 
 
 
465 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  27.14 
 
 
447 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  28.65 
 
 
473 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  29.08 
 
 
480 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
443 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  29.62 
 
 
474 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  29.56 
 
 
443 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  25.63 
 
 
444 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
480 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  29.08 
 
 
480 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.86 
 
 
444 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  28.57 
 
 
438 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  29.08 
 
 
480 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.86 
 
 
446 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  30.18 
 
 
411 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.35 
 
 
474 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  28.8 
 
 
476 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  28.24 
 
 
438 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  28.8 
 
 
476 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
385 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  27.16 
 
 
411 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.76 
 
 
418 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  26.96 
 
 
447 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  30.13 
 
 
481 aa  99.4  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.71 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  26.35 
 
 
471 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  25.33 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  26.95 
 
 
412 aa  96.3  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  27.65 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  30.59 
 
 
420 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  26.3 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>