204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0689 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  100 
 
 		 389 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  73.3 
 
 		 390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  66.32 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  61.62 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  57.69 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  57.42 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  57.69 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  55.59 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  56.72 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  56.45 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  56.45 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  56.45 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  49.08 
 
 		 386 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  48.81 
 
 		 384 aa  346  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  46.72 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  44.76 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30.85 
 
 		 411 aa  172  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30 
 
 		 431 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  31.93 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  30.99 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  33.43 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  31.66 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  30.83 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  30.08 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  30.28 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  30.28 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  30.28 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  34.59 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  30.28 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  30.05 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  28.3 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  28.3 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  28.7 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  28.12 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  26.98 
 
 		 427 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 446 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 446 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 446 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  27.85 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  26.97 
 
 		 520 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  25.2 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  25.69 
 
 		 434 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  25.69 
 
 		 434 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  27.61 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  28.36 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 474 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  25.76 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  25 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  26 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  24.48 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.5 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 481 aa  97.1  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  25.36 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  24.24 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.61 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>