223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000082 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  89.33 
 
 
356 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  100 
 
 
386 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  62.17 
 
 
384 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  58.18 
 
 
386 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  46.37 
 
 
390 aa  338  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  47.33 
 
 
389 aa  325  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  46.75 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  46.49 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  46.79 
 
 
390 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  44.76 
 
 
389 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  47.94 
 
 
389 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  47.21 
 
 
387 aa  316  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
388 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  44.93 
 
 
388 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  44.93 
 
 
388 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  44.93 
 
 
388 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  45.62 
 
 
388 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  32.21 
 
 
411 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  31.06 
 
 
382 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  31.06 
 
 
382 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  31.93 
 
 
384 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  30.9 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.41 
 
 
431 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  33.43 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  33.43 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  33.43 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  33.43 
 
 
382 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  32.24 
 
 
396 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  32.3 
 
 
382 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  33.13 
 
 
382 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  29.67 
 
 
430 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  31.58 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  31.28 
 
 
382 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
454 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  30.7 
 
 
432 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  31.12 
 
 
412 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  30.73 
 
 
382 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  28.09 
 
 
381 aa  139  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  31.07 
 
 
384 aa  135  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  29.19 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
436 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  26.14 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  25.99 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  23.9 
 
 
425 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.71 
 
 
412 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.08 
 
 
471 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
430 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  26.65 
 
 
480 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  27.43 
 
 
412 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  26.65 
 
 
411 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  24.7 
 
 
520 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  26.33 
 
 
444 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 
480 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  26.35 
 
 
480 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  25.5 
 
 
428 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  26.93 
 
 
412 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  26.35 
 
 
480 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  26.65 
 
 
476 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  26.35 
 
 
476 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  24.47 
 
 
481 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  26.35 
 
 
474 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  26.4 
 
 
471 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  27.56 
 
 
443 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  24.77 
 
 
474 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  26.4 
 
 
429 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  28.7 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  28.37 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  25.58 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  24.02 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  26.06 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  26.06 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  22.96 
 
 
459 aa  97.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  23.88 
 
 
418 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  24.07 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  25.36 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  25.45 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  27.24 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  26.06 
 
 
412 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  25.07 
 
 
446 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  25.07 
 
 
446 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  25.07 
 
 
446 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  24.04 
 
 
447 aa  93.2  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  26.27 
 
 
452 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  25.76 
 
 
410 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.1 
 
 
421 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.09 
 
 
465 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  24.7 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27.09 
 
 
473 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  24.7 
 
 
434 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  27.57 
 
 
464 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  24.86 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>