250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1723 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  91.41 
 
 		 384 aa  658    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  100 
 
 		 384 aa  751    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  76.96 
 
 		 382 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  70.76 
 
 		 382 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  70.5 
 
 		 382 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  69.82 
 
 		 396 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  69.53 
 
 		 381 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  67.45 
 
 		 382 aa  494  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  64.4 
 
 		 382 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  64.4 
 
 		 382 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  65.71 
 
 		 382 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  64.4 
 
 		 382 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  65.45 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  64.14 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  64.14 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  64.14 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  48.96 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  32.51 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  31.18 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 431 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  29.26 
 
 		 411 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  30.87 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 432 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  30.11 
 
 		 520 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  30.79 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  31.36 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  30.18 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 480 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 480 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 465 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 474 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  28.8 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  28 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  28 
 
 		 476 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 474 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  31.16 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 427 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.39 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  27.01 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.39 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  29.57 
 
 		 438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  30 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  27.55 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 464 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  28.92 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 471 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  32.07 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  24.43 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  27.35 
 
 		 726 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  27.27 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  29.65 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 713 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>