211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0691 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  759    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  62.17 
 
 		 386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  64.51 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  61.29 
 
 		 386 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  54.2 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  50.8 
 
 		 390 aa  348  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  48.81 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  52.32 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  52.04 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  53.91 
 
 		 390 aa  338  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  52.73 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3634  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  48.68 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  48.68 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  48.68 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3394  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 388 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  48.42 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  33.24 
 
 		 411 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  34.29 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  33.52 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  32.32 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  31.66 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  31.66 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 454 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  31.1 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  30.4 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  30.82 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  30.82 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  31.42 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  31.42 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  31.42 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  31.83 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  30.9 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  31.16 
 
 		 382 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  27.38 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 446 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 464 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  28.01 
 
 		 465 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 446 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 446 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  32.05 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 473 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 446 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.25 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.19 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  29.08 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 480 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.19 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  26.49 
 
 		 474 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  26.56 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  28.76 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.98 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  25.49 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  26.57 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 447 aa  99.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 471 aa  99.4  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  29.2 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>