214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  76.43 
 
 		 452 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  99.29 
 
 		 434 aa  812    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  100 
 
 		 434 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  71.85 
 
 		 444 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  75.12 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  71.85 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  72.31 
 
 		 447 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  71.1 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  76.32 
 
 		 436 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  72.25 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  58.51 
 
 		 438 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  58.51 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  56.24 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  55.39 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  56.24 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  56.24 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  52.58 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  52.57 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  52.34 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  51.62 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  51.68 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  51.68 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  51.68 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  51.68 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 436 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  34.66 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  30.02 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  30.27 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  35.19 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  29.54 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  33.01 
 
 		 443 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 431 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  31.64 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  27.91 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 454 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  33.24 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.32 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  29.8 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  30.81 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  26.12 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 429 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  28.94 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  29.23 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  28.65 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  28.65 
 
 		 382 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 421 aa  140  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  29.28 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  24.88 
 
 		 726 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 713 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  29.53 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  25.25 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  27.67 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>