215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2384 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  80.46 
 
 		 454 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  82.01 
 
 		 431 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  852    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  82.18 
 
 		 430 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  80.46 
 
 		 432 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  41.04 
 
 		 411 aa  263  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  35.17 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  34.91 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 412 aa  186  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  35.93 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 713 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  35.31 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  32.98 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  30.73 
 
 		 411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 418 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 418 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  34.34 
 
 		 429 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  35.36 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  30.94 
 
 		 726 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  30.69 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  30.23 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  31 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  34.81 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  33.07 
 
 		 381 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  32.22 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  32.22 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  32.22 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  32.22 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 444 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  32.3 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  32.29 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  31.94 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  32.63 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  32.77 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  31.67 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  31.94 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  28.09 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  31.36 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  33.88 
 
 		 384 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  32.6 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  31.43 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 433 aa  146  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  26.37 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  32.26 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  32.26 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  34.9 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  28.42 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 474 aa  143  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>