232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5608 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  100 
 
 		 438 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  99.09 
 
 		 438 aa  873    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  58.93 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  60.24 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  59.01 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  54.55 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  54.55 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  54.78 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  54.88 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  58.24 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  57.04 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  57.04 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  48.86 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  49.33 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  50 
 
 		 476 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 474 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 464 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  43.73 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  34.06 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  30.52 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  32.52 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  32.52 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  31.11 
 
 		 412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  33.9 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  30.63 
 
 		 397 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  33.02 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  30.62 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  29.9 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  33.67 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  31.09 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  27.66 
 
 		 395 aa  160  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.66 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  27.66 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  30 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  30 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  28.65 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.48 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 471 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 420 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26 
 
 		 713 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  29.8 
 
 		 427 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  24.2 
 
 		 726 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  26.72 
 
 		 412 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  31.28 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  31.31 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  26.93 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  28.46 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  29.57 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  28.65 
 
 		 382 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  28.37 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  28.37 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>