235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  99.09 
 
 		 438 aa  873    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  100 
 
 		 438 aa  882    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  58.93 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  60.24 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  58.77 
 
 		 452 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  54.55 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  54.65 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  54.31 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  57.04 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  57.04 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  57.77 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  48.86 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  46.3 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  49.77 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  49.22 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  50 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  44 
 
 		 385 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 417 aa  210  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  34.06 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  30.27 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  32.77 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  32.77 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  30.35 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  34.31 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  33.65 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  30.98 
 
 		 412 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 447 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  30.15 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  30.49 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  28.14 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  33.67 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  31.34 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  28.14 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  27.66 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 418 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.35 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 429 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  28.78 
 
 		 429 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  30.3 
 
 		 427 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 713 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 432 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  24.2 
 
 		 726 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  26.97 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 426 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  31.31 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  28.2 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  27.34 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  30.7 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  29.84 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  28.42 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  28.15 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  28.15 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>