221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0644 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  853    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  59.95 
 
 		 410 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  49.87 
 
 		 418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  49.61 
 
 		 418 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 432 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  38.32 
 
 		 412 aa  279  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 412 aa  275  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  37.82 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  38.86 
 
 		 427 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  35 
 
 		 421 aa  222  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  35.68 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 416 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 424 aa  206  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  31.93 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  32.49 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  33.95 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 430 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.43 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 408 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  33 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 726 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30.13 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  27.44 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 713 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  27.54 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  27.3 
 
 		 434 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  30.41 
 
 		 429 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  28.9 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  30.99 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  28.21 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  31.55 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  27.3 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  27.3 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 481 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  31.16 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 476 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  24.83 
 
 		 474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  28.03 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  28.34 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  26.61 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  28.03 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  24.79 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  27.71 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.55 
 
 		 407 aa  114  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  27.64 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2511  hypothetical protein  27.86 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  27.64 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  25.56 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>