251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1547 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  886    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  49.52 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  42.24 
 
 		 429 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  41.78 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 409 aa  250  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 420 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 432 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  36.54 
 
 		 412 aa  246  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  35.14 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 471 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  36.05 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  36.98 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  32.66 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  33.09 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  33.8 
 
 		 426 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  34.42 
 
 		 410 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  32.09 
 
 		 429 aa  219  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  35.78 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.65 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  31.91 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  31.4 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  30.49 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 473 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  35.83 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 447 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 726 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  30.22 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 480 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 		 480 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  31.36 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  29.49 
 
 		 474 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 476 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 439 aa  183  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  34.05 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  33.06 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  31.01 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  28.75 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  30 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  30.05 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  30.05 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  29.95 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  28.23 
 
 		 398 aa  153  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 432 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 421 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  32.84 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  26.23 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>