216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2491 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  91.63 
 
 		 454 aa  730    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  842    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  92.34 
 
 		 431 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  92.69 
 
 		 432 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  82.18 
 
 		 436 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  40.15 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  37.91 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  33.1 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  32.86 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 446 aa  176  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  35.71 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 417 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 713 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  33.13 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  34.96 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 390 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 473 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  34.4 
 
 		 465 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  30.79 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 471 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  34.44 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  33.09 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 447 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  30.6 
 
 		 434 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  29.21 
 
 		 520 aa  156  9e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  30.7 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  30.7 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  31.27 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  30.73 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  31.1 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  28.91 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 726 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  27.87 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 416 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  33.15 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  25.42 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0448  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3908  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3835  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4031  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  27.43 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  29.01 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0425  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 388 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  33.24 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  34.88 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  30.14 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0450  major facilitator family protein  34.41 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0452  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3577  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  29.52 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05696  hypothetical protein  30.86 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  35.26 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  31.25 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000082  permease  30 
 
 		 386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0172441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1723  putative MFS family transporter protein  33.33 
 
 		 384 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  31.15 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  31.99 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>